2016, Star City. Le capitaine Hunter ramène les Légendes à leur époque, 5 mois après leur départ. Il va remettre leurs alter-egos dans le flux temporel. Savage détient toujours Kendra et Carter. Mais ils n’ont aucun moyen de le localiser en encore moins de le tuer. Rip repart sans eux.
Sara Lance retrouve son père à Star City et apprend la mort de sa sœur. Elle a été tuée par Damien Darhk. A Central City, Mick Rory fait un braquage avec un nouveau complice. Mais il n’est pas à la hauteur et il le tue. Ray Palmer retrouve Mick. Il lui présente des excuses pour Léonard Snart. Ray veut repartir à la recherche de Savage. Martin Stein passe la soirée avec sa femme. Le lendemain il retourne avec Jefferson là où Rip les a déposés. Ils retrouvent le reste de l’équipe. Ils essaient de contacter le Waverider quand il atterrit justement sous leurs yeux. Ils mettent les choses aux points avec Rip. Aucun ne renoncera à éliminer Savage. Ils embarquent tous à bord du vaisseau.
1944, Saint-Lô : Kendra court dans la forêt, poursuivie. Elle tombe sur un soldat français. Elle laisse un message dans son casque quand Savage surgit, l’étrangle et tue le soldat.
Dans le Waverider, Sara veut remonter le temps pour sauver sa sœur. Rip utilise son pistolet pour lui faire perdre connaissance. Un casque tombe au sol. Il semble être surgit de nulle part. Il contient le message de Kendra avec sa localisation dans le temps et l’espace. Ils partent donc pour Saint-Lô en 1944.
A cette époque Savage fait des révélations à Kendra et Carter. Leurs sangs contiennent la clé de la technologie des extraterrestres qui envahiront la Terre. Ces mêmes extraterrestres ont envoyé 3 météorites sur la Terre à trois moments différents. C’est l’une d’ente elle qui a donné leurs pouvoirs à Savage, Kendra et Carter. La deuxième a atterrit en 1958 à Harmony Falls. Savage veut utiliser le sang de Kendra pour réactiver le vaisseau temporel et remonter le temps jusqu’en 1700 av JC, là où tout a commencé.
Au Waverider le capitaine Hunter parle avec Sara. Elle le supplie de remonter le temps pour qu’elle puisse sauver sa sœur. Seulement quand elle est partie le flux temporel a été altéré. Si elle était restée, elle était morte, ainsi que sa sœur et son père. D’après Rip il n’y a rien à faire pour sauver Laurel. Face au désespoir de Sara, Rip essaie de redonner lui confiance. Le Waverider arrive en 1944, à Saint-Lô.
Savage interrompt un convoi allemand. Il veut leur cargaison. Il les attaque quand il est interrompu par Mick, Ray et Sara pendant que Firestorm au vaisseau de Savage, libère Kendra et Carter. Néanmoins Savage a réussi à récupérer le chargement, qui se trouve être la troisième météorite. Dans leurs fuite Kendra est touchée. Dépassés par le nombre l’équipe retournent au vaisseau en laissant Kendra derrière.
Dans le flux temporel Carter leur apprend les plans de Savage. Il n’a pas totalement retrouvé la mémoire mais n’est plus une menace pour l’équipe. Le professeur comprend comment Savage compte effacer le temps. Il compte faire exploser les trois météorites, chacune à une période différente. La réaction en chaine les ramènerait à la première explosion, soit en 1700 av JC. Toutefois il faut choisir une période précise pour chaque. En effet la Terre doit être alignée avec la planète extraterrestre, soit, d’après les calculs du professeur Stein : en 1958, 1975 et 2021.
Savage retrouve lui-même en 1958. Il expose son plan à son alter égo et lui donne le sang de Kendra.
A bord du Waverider, Martin, Jax, Carter et Rip concluent que pour tuer Savage il faut le tuer 3 fois, à ces trois époques. Les Légendes vont se répartir en 3 équipes. Carter et Rip sont en 2021 à St Roch et surveillent Savage et Kendra. Mick et Ray sont en 1958, à Harmony Falls tandis que Sara et Firestorm sont en 1975 en Norvège. Les trois Savage commencent le rituel. C’est à ce moment que les Légendes l’attaquent. Sara combat Savage. En parallèle Ray est pris avec une créature ailée pendant que Mick se bat contre Savage. Kendra, en 2021 se libère de ses liens et rejoins Carter pour affronter Savage. Sara Lance, Mick Rory et Rip Hunter parviennent à tuer Vandal Savage.
Ensuite Firestorm et Ray Palmer détruisent les météorites. Le Waverider les regroupent tous en 2021. Il reste une météorite. Mais ils n’arrivent pas à la détruire. Elle est sur le point d’explosion. Rip embarque, seul, à bord du Waverider avec la météorite. Il fait ses adieux à ses équipiers et se dirige vers le Soleil. Il a prévu de larguer la météorite dans le soleil et d’effectuer un saut temporel de 10 min en arrière. Il retrouve l’équipe sain et sauf.
Les Maitres du temps ne sont plus une menace et Vandal Savage est définitivement mort. Il souhaite reprendre ses fonctions et surveiller le flux temporel. Il propose aux autres de se joindre à lui.
En 2016 à Star City, Sara se recueillir sur la tombe de sa sœur ave son père. Son père l’incite à repartir. Martin passe la soirée avec sa femme. Il a décidé de décliner l’offre de Rip. Il ne veut plus quitter sa femme. Cette dernière, en accord avec Jax, l’incite au contraire à accepter. En 2013, à Central City Mick est dans un bar. Il retrouve Léonard Snart. Ils ne partiront à travers le temps que dans 3 ans. Bouleversé après l’avoir vu mort, Mick essaie de lui dire quelque chose. Il s’apprête finalement à partir mais finit par lui dire qu’il est le meilleur et que pour lui il est un héros. Puis il s’en va. Hunter et Palmer l’attendent à l’extérieur. Mick n’a pas pu dire à son ami qu’il s’est sacrifié dans le futur pour sauver son destin.
Hunter retrouve l’équipe au complet en 2016 à Star City. Kendra et Carter déclinent l’offre. Avec la mort de Vandal Savage ils veulent prendre un nouveau départ. Les autres suivent Rip quand un vaisseau similaire au Waverider atterrit. Un homme en sort. Il les prévient que s’ils montent à bord du Waverider ils sont tous condamnés. Il est envoyé par Mick. Il s’appelle Rex Tyler, membre de la Société de Justice d'Amérique.