Lorsque Ben et le Docteur arrivent auprès de Thous, il est encore en vie. Ils emmènent Thous en lieu sûr.
Jacko, Sean et Ara attendent le Docteur, craignant une explosion imminente.
Le Docteur confie Thous à Ara et est très inquiet quand il apprend que Polly et Jamie se sont rendus au laboratoire pour le chercher.
Pour arrêter Zaroff, le Docteur envisage d'inonder le temple et le laboratoire. Il demande à Sean et Jacko d'emmener les Atlantes dans les niveaux supérieurs.
Ben et le Docteur vont se rendre à la centrale électrique pour augmenter la puissance du réacteur et briser les parois pour inonder le laboratoire. Le Docteur espère que tout le monde sait nager.
Au laboratoire, le technicien surveille les machines, il ne reste plus que 10 minutes avant l'explosion.
Dans la salle du réacteur, une des jauges est fluctuante. Zaroff ordonne qu'on puise dans les réserves malgré les hésitations de l'homme de maintenance.
Un troisième homme annonce que la station 11 est inactive, désertée de ses travailleurs qui cherchent de la nourriture. Ils n'ont pas été ravitaillés et on craint la famine. L'homme a appelé les gardes pour éviter un arrêt complet de la station. Zaroff leur dit de faire de leur mieux, il enverra des hommes dès que possible.
A la centrale électrique, le Docteur et Ben sont confrontés à un garde et le Docteur se fait passer pour le prisonnier de Ben. Le garde demande le mot de passe mais Ben s'en sort en disant qu'il ne peut le connaitre car il a couru après cet homme toute la journée. Zaroff lui a demandé de l'amener là et d'attendre. Après avoir passé les gardes, le Docteur dit à Ben de briser la vitre et de couper les câbles. Le Docteur actionne des leviers, agissant un peu au hasard, et ils se dirigent ensuite vers le laboratoire pour voir les effets de leurs manipulations.
Consultant ses cadrans au laboratoire, Zaroff craint une fuite radioactive.
Polly et Jamie, égarés dans les tunnels, se trouvent juste sous la source d'énergie de Zaroff. Au loin, ils aperçoivent un mur particulièrement brillant, peut-être à cause des radiations. Jamie ne connait pas ce mot et Polly ne sait comment lui expliquer. Les vibrations du mur risquent de le faire céder, déjà l'eau s'infiltre. Polly et Jamie doivent grimper aussi vite que possible le long des parois.
Sean, Jacko, Ara et Thous se reposent dans le temple, mais l'eau commence à l'inonder. Ils vont devoir eux aussi trouver une issue. Ils sont rejoints par Damon qui regrette la perte de son laboratoire.
Zaroff espère toujours faire exploser sa bombe, il n'a aucunement renoncé à son projet. Lorsque le Docteur le rejoint, il fait remarquer aux techniciens qu'ils sont bien dévoués pour accepter de se laisser exploser de la sorte. Il annonce à Zaroff que la mer a commencé à s'infiltrer. Les techniciens prennent la fuite. Zaroff actionne une commande et une herse descend, isolant le Docteur et Ben de Zaroff et des commandes activant la bombe. Le Docteur manipule alors le générateur et plonge la pièce dans l'obscurité. Zaroff relève la herse et s'avance pour prendre une arme. Il veut ligoter le Docteur mais Lolem qui vient d'arriver le distrait et le Docteur en profite pour abaisser la herse et empêcher Zaroff d'atteindre le levier qui permettrait de faire exploser la bombe. Zaroff tire en direction de Lolem tandis que le Docteur et Ben prennent la fuite. Le niveau de l'eau continue de monter. Pris de remords, le Docteur veut aller sauver Zaroff de la noyade mais Ben le force à le suivre pour remonter et sauver leur vie.
Polly a perdu tout espoir, elle est à bout de force. Jamie l'encourage, lui promettant de l'aider. Après avoir grimpé longtemps, Jamie et Polly ont réussi à atteindre la surface de l'île. Peu à peu, d'autres survivants apparaissent.
Damon se demande ce que le Docteur est devenu mais Ara pense qu'il a du se noyer en les sauvant. Thous annonce qu'ils érigeront une stèle en son honneur dans le temple. Damon dit qu'il ne veut plus de temple, ce sont les superstitions qui les ont conduits à suivre Zaroff. Lorsque le niveau d'eau se sera stabilisé, ils construiront une nouvelle Atlantide, sans temple, sans Dieu, sans hommes poissons. Thous convient que c'est ça qui sera son mémorial.
Le Docteur et Ben arrivent à la surface. Jamie et Polly sont soulagés de les revoir. Ils se dirigent vers le Tardis.
Sean et Jacko ont eux aussi réussi à atteindre le rivage, et ils sont surpris d'y voir une cabine téléphonique de police mais elle disparaît sous leurs yeux.
Dans le Tardis, Jamie avoue que tout cela est merveilleux. Il ne comprendra jamais comment ça fonctionne mais il s'y sent en sécurité. Ce sont les choses de l'extérieur qui font peur. Toutefois, Jamie aimerait savoir s'il est vrai que le Docteur ne peut contrôler l'endroit où ils se rendent. Le Docteur dit qu'il saurait, mais qu'il ne le souhaite pas, ce qui fait sourire ses compagnons. Pour le prouver, le Docteur annonce "Direction Mars". Et il perd le contrôle du Tardis, reprochant à ses amis de l'avoir incité à trafiquer la direction.
Source : La Séance du Docteur