Ce sont les fêtes d'Halloween. Alors que le groupe d'études est costumé dans la salle, Jeff remarque que Troy et Abed sont immatures dans leurs costumes et font fuir les femmes. Pierce, lui, est tombé malade après avoir mangé un taco avarié. Avec l'aide d'Annie, mais aussi celle de Rich, au grand désespoir de Jeff, Pierce est placé en quarantaine.
Le doyen envoie Rich s'occuper d'autres étudiants malades mais son diagnostic est interrompu par Pierce qui a mordu Rouflaquettes, lequel présente des symptômes identiques, bien que n'ayant jamais consommé de tacos.
Une épidémie se déclare et le doyen n'arrive pas à appeler les fournisseurs de tacos. Quant aux étudiants, ils deviennent les uns après les autres contaminés et le doyen Pelton enferme le groupe d'études (sauf Pierce) avec Chang et Rich dans la salle d'études F afin de les isoler.
Mais la quarantaine tourne court car Rich décrit les symptômes avant de se rendre compte qu'il en est lui aussi porteur et attaque le groupe, de même que Britta. Puis c'est au tour d'Annie d'être mordue.
Pendant que le doyen appelle un service de désinfection, Chang et Shirley s'embrassent avant d'être mordus à leur tour.
Puis, Jeff, Abed et Troy décident de prendre la fuite. Ils disposent d'une solution pour enrayer le processus, il faut qu'ils parviennent à régler la température de sorte à geler le cerveau des zombies. Jeff choisit la mauvaise sortie et se fait mordre. Puis, c'est au tour d'Abed.
Troy est le dernier survivant et il parvient tout de même à régler la température avant qu'Abed ne l'ait totalement contaminé.
Tout redevient normal et le doyen fait croire aux étudiants qu'ils ont vécu un bad trip.
A la fin, Troy écoute sur sa boîte vocale un message que Chang lui a laissé, en lui disant qu'il avait couché avec Shirley.