Brian est devenu une sorte de victime de Stewie qui s'amuse à remonter le temps afin de l'insulter. Stewie le découvre. Dès lors, ils se battent et doivent racheter du plutonium pour que la machine remarche. Bertram les espionne et tente de tuer Léonard de Vinci, qui est l'ancêtre de Stewie, afin que ce dernier ne naisse pas. Pour l'en empêcher, Brian et Stewie unissent leurs forces et réussissent à tuer Bertram. Mais sa mort n'a pas effacé la naissance de Stewie et encore moins l'univers.
On découvre ensuite que Stewie a injecté son propre ADN à la petite amie de Léonard de Vinci et s'est cryogénisé dans le futur.